源流は芦ノ湖・逆川口ですが、やがて水は箱根仙石原の地下に入り、仙石原湿原の東北より湧水となって湧き出します。箱根外輪山と中央火口丘の間を深い谷を造って流れます。

　芦ノ湖から小田原の河口までは20.5Kmですが、、標高差723mの急流で、かってはたびたび水害を引き起こしました。