現在、箱根山のある地域は2500万年ほど昔は海底でした。 海底火山の噴火やプレートの移動により陸地が形成されました。 　
　箱根の火山活動は約40万年前に始まり、10-20万年かかって標高2700ｍ程度の富士山型の箱根山が出来たと推定されます。 　
　爆発が収まり、マグマが収縮した為、20万年前頃、この箱根山の中央部が直径約8ｋｍにわたって陥没し、複雑な地形の火山となりました。 　
　15万年ほど前から火山活動がまた始まり、4万年前には大爆発が起り、その時の火砕流は横浜まで達したと考えられています。 　
　さらに2万年前の火山活動により早川がせきとめられて現在の箱根・芦ノ湖が形成されたと考えられています。 　
　箱根の外輪山に囲まれた地域の山々はこの3回の大きな火山活動により作られました。